Terdapat beberapa jenis fauna yang ditemukan di ekosistem mangrove PT PJB UBJ O&M Paiton yang terinventarisasi pada tahun 2021 diantaranya yaitu fauna burung, herpetofauna, mamalia, Lepidoptera, dan odonata. Jumlah total keseluruhan jenis fauna tersebut yaitu sebanyak 48 jenis, dengan jumlah masing-masing jenis diantaranya 21 jenis burung, 2 jenis herpetofauna, 2 jenis mamalia, 17 jenis Lepidoptera (kupu-kupu) dan 5 jenis odonata (capung). Dari 21 jenis burung yang terinventarisasi, ditemukan 9 jenis baru teridentifikasi dan 9 jenis lainnya tidak terinventarisasi kembali. Jenis herpetofauna pada tahun 2021 mengalami penurunan jika dibandingkan dengan tahun pemantauan 2020 dengan 1 jenis baru terindentifikasi dan 2 jenis lainnya tidak teridentifikasi kembali, sedangkan jenis mamalia mengalami peningkatan dengan 2 jenis baru teridentifikasi. Untuk fauna jenis Lepidoptera dan odonata juga mengalami peningkatan jika dibandingkan dengan tahun sebelumnya.
